acerator: Si en tu horno te salieron mejor como dices, dejándolas sólo unas horas de reposo etc pues hazlas así...no tienes que seguir una receta al pie de la letra, cada horno es diferente como los ingredientes, todo influye.
Por ejemplo el tiempo que comentas de horneado a mí me parece súper excesivo pero si en el tuyo necesitan tanto, pues lo tendrás que hacer...
Y no debes llenar mucho la bandeja porque, al menos en mi horno, no llega bien el calor a todos lados como en el centro y no recomiendo para nada el aire si es en preparaciones que tengan que subir, ásí que para magdalenas no pongo nunca más de 12 unidades por hornada
prueba a poner menos en la hornada, yo como max pongo 12, hace poco lei en una pag, ahora no recuerdo cual era que cuando la magdalena se baja es porque no esta totalmente cocida 
lo que no se es si esto es verdad, a lo mejor si llenaste mucho la bandeja necesitaban algo más de tiempo en el horno.
